《2024年第二系列总稽查司报告》揭露国家教授理事会存在多项弊端，但该理事会却表示，相关问题都是因为政府停止拨款予该理事会所致。

教授理事会发表文告指出，政府在2018年议决解散该理事，随即就终止了对理事会的拨款，一直到2022年1月恢复拨款之前，理事会被迫采取多项措施，以维持自身的运作。

国家教授理事会隶属首相署，由高教部长担任顾问，理事会事宜必须向高教部长汇报。

而前首相敦马哈迪在2018年重新担任首相时，下令关闭国家教授理事会，一直到2021年11月在前首相拿督斯里依斯迈沙比里上台后，才重新获得政府认可，而在这之前该理事会都是独立运作。

然而，根据《总稽查司报告》，报告中所提到的问题，都是在教授理事会重新获得拨款后发生。

报告中点出的问题包括了，理事会动用37万3516令吉的资金承担两家企业的运营费，而相关公司最大的股东则是理事会主席兼执行长兼信托委员会总秘书和信托委员会前副总秘书。

此外，报告也点出，理事会在未经过高教部审批的情况下，给理事会主席和首席执行员支付总额达20万7000令吉的津贴。

而理事会高层管理员的薪资，也在未获得信托委员会审批的情况下，在2022年至2023年期间调涨10%。

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