台湾的教育部周二未针对有意参与台湾科技大学校长遴选的台湾大学化工系教授李笃中，被爆曾透过中国“长江学者”奖励计划获中国的大学聘用一事直接回应，仅称参与校长遴选的候选人，均由遴选委员会透过决议，要求候选人充分揭露相关讯息，以确认有否违法。

据台媒报道，李笃中曾名列2006年度中国长江学者奖励计划，接受哈尔滨工业大学聘任至少3年，长年拿取中国政府经费做研究。台教育部初步回应称，台湾公私立科研机构及大专校院现职专任教师及相关人员，未经许可不能应聘到中国任教，也不得参与中国各项公有基金及重点研发计划（如千人计划）。

李笃中受访时表示，长江学者是兼任性质，但他“没签约也没接受”，也没领奖金，“因为太低了”。他指长江学者奖金一个月约6万元新台币（约马币8500令吉），但食宿要自己负责。

2018年台湾大学校长当选人管中闵也被检举曾赴中国厦门大学兼职任教，教育部当时召开跨部会谘询专案小组厘清争议，最后认定并未违规。